Det øverste styringsorganet ved Høgskolen i Harstad, er Høgskolestyret hvor rektor er styreleder. Høgskolestyret har 11 medlemmer hvorav fire er eksterne representanter. Studentene er representert med to medlemmer. Direktøren innstiller i saker som behandles av styret, men er ikke medlem av styret.
Rektor og prorektor er valgt for en periode på fire år, mens direktør er tilsatt.
Rektor Inger Aksberg Johansen (2003 – 2007 – 2011).
Prorektor Trond Hammervoll (2007 – 2011).
Direktør Hugo Thode Hansen.
Den faglige virksomheten organiseres i institutter. Institutt for Helse- og sosialfag og Institutt for Økonomi- og samfunnsfag. Instituttene har hver sin instituttleder som har det faglige og administrative ansvaret.
Institutt for Økonomi- og samfunnsfag. Instituttleder Bodil Olsvik.
• LOS (ledelse, organisasjon og styring). Seksjonsleder Harald Thorsteinsen.
- Videreutdanning i ledelse
• Tjenesteyting. Seksjonsleder Thomas Gressnes.
- Advanced Marketing
- Handel, service og logistikk
- Revisjon
- Økonomi og administrasjon
• Reiseliv og turisme. Seksjonsleder Øystein Normann.
- Reiseliv og turisme
- Produsentstudiet
